上海益启生物科技有限公司
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试剂、原辅料包材、细胞库 / 细胞培养、实验室仪器 / 设备、技术服务、耗材、抗体
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公司新闻/正文
“你”,是越过高原沙漠留下的痕迹,是穿过江河湖海烙下的文明
人阅读 发布时间:2021-08-27 10:19
公司的小朋友都下班回家提前庆祝六一儿童节了,小编也想早点回家,But想想这个月的KPI还没完成,这会儿琢磨着写点什么东西来着,就写一首小诗送给大家,哈哈哈哈提前祝大家儿童节快乐
看来稳定输出很重要啊
不然会像小编一样拖到月底还在琢磨着写点什么干货给大家
说到稳定输出,小编的灵感就来了
那和高原沙漠,江河湖海啥关系呢?
我们知道,搞科研的不全是动物,比如小鼠、大鼠、兔子神马的,也有研究植物的,比如水稻,拟南芥啥的,这些都是看的见的,还有一些老师是研究环境微生物领域,很多样本是看不见的。
土壤是环境样本中最常见的类型,土壤样本种类众多,含有丰富的微生物,但这些微生物会与土壤颗粒紧密结合,很难分离,经常会导致菌体裂解不完全,DNA条带弥散;并且土壤中还存在大量抑制剂,如腐殖酸等,导致提取的DNA纯度差,洗脱液有颜色。
这些难题怎么解决呢?今天就分享如何稳定输出,不能像小编一样写文章全靠灵感
先来看看小诗里的高原和河流湖泊样本吧:
分享1
样本类型:高原植物根系土壤
面临挑战:提取高原植物根系土壤,含腐植酸较高。对比了若干款进口和国产DNA试剂盒后,存在DNA提取纯度低太低问题。
试用结果数据:
试用体验:1、提取时间大大缩短;2、操作相对比较简便;3、提取效果相对较好,降解减少;4、260/230有所提高,杂质减少。
分享2
样本类型:河流湖泊沉积物
面临挑战:DNA提取效果差
试用结果数据:
试用体验:提取的DNA纯度有明显提高,260/230远大于1.0,DNA纯度较好,提取操作步骤比较简便。
再看下农田土壤,蚯蚓肠道内容物和所在土壤和微生物样本:
分享3
样本类型:农田土壤
面临挑战:提取DNA效果不理想。
试用结果数据:
分享4
样本类型:蚯蚓肠道内容物和所在土壤
面临挑战:客户自备的试剂盒,DNA提取浓度比较低(37.2ng/μl),260/280为1.796,纯度仅为0.044,后续要做扩增子测序和高通量芯片荧光PCR,不能满足后续实验要求。试用体验:
结合MP公司提供的技术建议,经实验优化后,DNA提取浓度和纯度都有所提升,肠道内容物浓度为87 ng/μL,土壤样本浓度为48 ng/μL,260/230为1.4。目前提取出的浓度已满足下游的实验用量。
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样品类型:水管内壁生物膜,提取管道内的淤泥和滋生的各种微生物
面临挑战:DNA提取纯度低
试用结果数据:
试用体验:试用后A260/230达到了1.73,纯度大大提高,对实验结果满意。
那这些试用是什么DNA提取试剂盒呢?
都是选择MP Biomedicals比较新产品土壤基因组DNA提取试剂盒(柱膜法)——SPINeasy DNA Kit for Soil,下面给大家简单介绍下这款土壤基因组DNA提取试剂盒。
绝招一
独特的裂解介质管,由三种不同粒径的研磨珠组成,提供的剪切力可以高效打开难裂解的菌体,促进核酸的释放,以保证微生物多样性。样本裂解均匀,以保证实验的平行性和稳定性。
绝招二
独特的裂解液体系,多种裂解液相互配合,能有效裂解菌体细胞,保护DNA完整性,并去除污染RNA。
绝招三
独特的抑制物去除体系,在DNA与柱膜结合前去除大部分腐殖酸,能够有效改善高腐殖酸含量样本DNA的提取纯度。
绝招四
高品质的硅胶柱膜及配套耗材,能特异性高效吸附核酸,最大限度截留DNA分子,且柱容积大,可以减少结合时离心的次数。
四大绝招傍身,各种类型土壤的样本统统搞定,再让我们看看TA在江湖上的表现吧。
1.好不好用,数据来说话
1.提取不同类型土壤基因组DNA收率及纯度结果
含高腐殖酸有机营养土、水稻土、花坛土、盐碱土、沙漠土等土壤样本,DNA提取收率及纯度结果如下表:
结论:SPINeasy DNA Kit for Soil可用于提取多种类型土壤基因组DNA,提取浓度高、纯度好。
2.提取不同类型土壤基因组DNA电泳结果
结论:采用SPINeasy DNA Kit for Soil提取多种类型土壤基因组DNA,电泳条带清晰,无弥散。
3.提取不同类型土壤基因组DNA进行PCR结果
备注:260/230比值大于1.0视为提取效果良好。
结论:实验证明,SPINeasy DNA Kit for Soil与市场上其他土壤基因组DNA提取试剂盒相比,具有更高的产量和更好的纯度,提取效果更稳定。
3.想不想要,申请就拥有