上海益启生物科技有限公司
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What??明明是同一个粪便,为什么他提取的 DNA的纯度总比我高?
人阅读 发布时间:2021-08-24 14:45
新冠以来,大家对于微生物的研究越来越重视,无论做肠道疾病相关研究,或者新冠病毒检测,都需要做粪便DNA提取实验。
既然是科研也没办法,毕竟在为人类健康和生物学的知识作贡献。可是不能接受DNA提取的收率和纯度很低,提不出来就不得不天天跟粪便打交道…
先不说样品采集流程操作步骤繁琐
样本前处理耗时耗力
交叉污染风险
样本保存不当的降解风险
还有提取的收率和纯度低
这么多不可控的风险以及为了减少采样次数……当然是做的次数越少越好,实验时间越短越好,粪便DNA提取的收率和纯度越高越好~
这么好的事情可能吗?
专为粪便DNA提取而设计
还真有!MP Biomedicals 新推了一款柱膜法粪便DNA提取试剂盒,SPINeasy DNA Kit for Feces是一款专为粪便DNA提取而设计的试剂盒。采用高结合力的硅胶柱膜,可在快速离心的过程中高效结合DNA,满足微量环境样本的提取。
试剂盒步骤简单,可以在25分钟内完成核酸的提取,无需酚、滤仿等试剂,安全快速可靠,满足大批量样本提取需求,减少人为因素干扰。不仅能让实验过程化繁为简,还能让得到的 DNA 又多又纯,我们来一一拆解下:
1.可适用于不同来源的粪便样本提取DNA
可适用于不同来源的粪便样本提取 DNA:从人、鼠、猪、鸡、羊、牛等不同粪便中提取高纯度gDNA,不同样本的特点不一样,有一个覆盖各种常见样本的粪便样本提取试剂盒就很省心了。
2.提取浓度高、纯度好
再来比较下提取效果,我们做了一些对比试验,结果如下:
DNA收率效果对比——产量高:
洗脱下来的DNA中盐离子、色素、RNA、蛋白质等杂质残留,会影响到230nm、260nm、280nm的光吸收峰,仅凭紫外吸收检测浓度不能够客观反映DNA的收率;
从上面图中发现MP的收率效果应不是特别突出,所以我们还得做一个电泳结果的对比,电泳是提取浓度的真实反映。
电泳结果可以看出,其他品牌虽然紫外浓度检测值很高,但电泳图上条带微弱,MP柱膜法粪便基因组DNA提取试剂盒能做到紫外检测浓度与电泳结果保持一致。
与其他厂家试剂盒DNA纯度对比——纯度高
我们知道260/280 比值在 1.7~2.0 范围视为提取效果良好,260/280比值大于2.0说明有RNA等污染;
260/230比值大于1.0视为提取效果良好,260/230低于1.0则可能存在多糖、盐类或蛋白残留。
从上面2张图可以看出,MP粪便基因组DNA提取试剂盒 (柱膜法) :提取纯度高于平均水平,且都在DNA纯度正常范围内,提取效果稳定;
为啥其他品牌提取DNA存在260/280比值偏高和260/230比值偏低呢?
洗脱DNA中可能存在RNA、盐离子等杂质,整体提取效果不佳!
小编仔细比较了Q品牌和MP的试剂盒组分,大家可以看看:
MP柱膜法粪便DNA提取试剂盒包含了RNA酶,另外提取的gDNA不含抑制剂,可用于后续分析,如PCR、限制性酶切和测序,丰富更多下游应用。
3.实验用时更短
我们比较了MP和其他品牌的操作用时:
MP粪便基因组DNA提取试剂盒 (柱膜法) 耗时最短,可在25 min内完成DNA提取。
省下的时间可以刷抖音,哦不~用来看文献嘛~
4.更环保、更安全
MP柱膜法粪便DNA提取试剂盒常温储存,无需酚、滤仿等试剂,安全快速可靠,满足大批量样本提取需求,减少人为因素干扰。
5.保障体系为产品保驾护航
试剂盒配有研磨介质 Lysing Matrix E,含有三种不同材质和直径的研磨珠,能有效裂解难以破碎的革兰氏阳性菌、真菌等微生物。
可结合Fastprep 裂解仪,动力强劲,独特模式的机械震动带动研磨介质与微生物高速碰撞,在短时间内裂解样品中的微生物;另外,试剂盒还配备对核酸高特异性的结合柱,减少对杂质的吸附,提高核酸吸附载量。
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